Harmonisation, intégration et analyse des données

Nous évaluons les bases de données, les systèmes d’information et les processus de production de rapports existants afin de déterminer s’ils sont prêts pour l’intégration, la recherche et l’analyse. Nos activités comprennent l’inventaire des données, le profilage des systèmes sources, l’examen des métadonnées, l’identification des lacunes de qualité et l’élaboration de feuilles de route de mise en œuvre avec des priorités, des besoins en ressources et des livrables convenus. Contactez-nous si vous souhaitez évaluer votre dispositif et identifier ses lacunes.

Nous standardisons les jeux de données hétérogènes au moyen du modèle commun de données Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP CDM) et d’autres structures adaptées à l’usage prévu. En nous appuyant sur l’écosystème Observational Health Data Sciences and Informatics (OHDSI), nous établissons les correspondances entre sources et cibles, alignons les concepts cliniques, harmonisons les unités et les dates et documentons les décisions de transformation. La correspondance terminologique comprend un examen clinique des codes locaux et de leurs relations avec les vocabulaires et classifications établis.

Nous concevons et maintenons des chaînes d’extraction, de transformation et de chargement (ETL) reliant les dossiers médicaux électroniques, les systèmes de laboratoire, les registres, les enquêtes et les bases de données de programmes. Les sources peuvent inclure OpenMRS, OpenClinic GA et d’autres systèmes d’information de santé. Nos services comprennent les mises à jour automatisées, le développement d’interfaces, la validation des données de migration et le rapprochement autorisé des dossiers. Lorsque cela convient, nous mettons en œuvre des interfaces utilisant Health Level Seven (HL7) Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR).

Nous évaluons l’exhaustivité, la cohérence, la plausibilité, les doublons et la conformité aux spécifications de données convenues. À l’aide d’outils tels que l’OHDSI Data Quality Dashboard et Achilles, complétés par une revue clinique et un rapprochement avec les données sources, nous identifions les problèmes et accompagnons les mesures correctives. Les livrables comprennent des rapports de qualité, des tableaux de bord de suivi et une documentation des limites pertinentes pour chaque usage analytique prévu.

Nous accompagnons la planification des études, la définition des cohortes, l’analyse statistique et l’interprétation des données cliniques et de santé des populations. Les applications comprennent la surveillance des maladies, le recours aux soins, les résultats thérapeutiques, l’évaluation des programmes et la recherche observationnelle. Nous développons des processus analytiques reproductibles, des tableaux de bord interactifs et des rapports scientifiques, avec des indicateurs, des dénominateurs et une incertitude clairement définis.

Nous développons et évaluons des modèles d’apprentissage automatique pour des questions définies de recherche et de systèmes de santé, notamment la prédiction des risques, les prévisions et la détection d’anomalies. Nos services couvrent la préparation des jeux de données, l’élaboration de variables, la comparaison des modèles, la calibration, la validation dans différentes populations et l’évaluation des différences de performance entre groupes. Lorsque les modèles sont mis en exploitation, nous accompagnons leur suivi et leur réévaluation périodique.

Nous aidons les institutions à établir des réseaux d’analyse dans lesquels les organisations participantes conservent le contrôle de leurs jeux de données locaux. Les services comprennent la configuration des nœuds d’analyse, la coordination d’études distribuées et la mise en œuvre de l’apprentissage fédéré entre les institutions participantes. Les analyses approuvées sont effectuées selon des contrôles d’accès, des vérifications de divulgation et des modalités de gouvernance convenus ; les résultats d’analyse comme les mises à jour des modèles sont examinés avant tout partage.

Nous prenons en charge les dictionnaires de données, les catalogues, les registres de provenance, les procédures d’accès et les processus appropriés de dé-identification. Nos services techniques comprennent le déploiement et la maintenance des bases de données analytiques et des environnements OHDSI, notamment Broadsea, ATLAS et WebAPI, lorsque pertinent. Nous entretenons les chaînes de traitement, mettons à jour les vocabulaires et les correspondances, surveillons l’actualisation des données, résolvons les pannes et documentons les changements en collaboration avec les responsables institutionnels des données et les équipes d’infrastructure.

Nous proposons des formations pratiques sur OMOP CDM, la correspondance terminologique, le développement ETL, la qualité des données, l’analyse et la recherche fédérée. Les formations peuvent combiner ateliers, mise en œuvre supervisée et mentorat continu. Le transfert comprend le code source convenu, la documentation de configuration, les procédures d’exploitation et les consignes de maintenance, afin d’aider les institutions partenaires à pérenniser et à développer leurs propres capacités.